domingo, 26 de julho de 2020

#22 EMBRAPA / UNICAMP 102012031096 - MÉTODO E USO PARA VERIFICAÇÃO DE ERROS DE MONTAGEM EM GENOMAS

102012031096 - MÉTODO E USO PARA VERIFICAÇÃO DE ERROS DE MONTAGEM EM GENOMAS

Depósito: 05/12/2012

Destaque: Prêmio Inventores Unicamp 2020

Inventor: Michel Eduardo Beleza Yamagishi (DF) e Roberto Hirochi Herai 

Empresa:  Embrapa Informática Agropecuária/DF e Unicamp/SP

O Método e uso para verificação de erros de montagem em genomas recebeu o Prêmio Inventores Unicamp, edição 2020, na categoria de patentes concedidas. A autoria é dos pesquisadores Michel Eduardo Beleza Yamagishi, da Embrapa Informática Agropecuária, e Roberto Hirochi Herai, professor da Escola de Medicina da Pontifícia Universidade Católica do Paraná (PUC-PR), doutor pelo Instituto de Biologia da Unicamp e ex-bolsista da Unidade pela Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (Fapesp). A patente foi submetida pela Embrapa e pela Universidade por meio da Inova Unicamp e concedida em 2019. O método criado pelos pesquisadores busca orientar a montagem em genomas, uma vez que existem poucas métricas para avaliar a qualidade dessas montagens. 

Resumo 102012031096 : A presente invenção trata-se de um método para verificação de erros de montagem em genomas de organismos sequenciados ou produzidos de maneira sintética que utiliza relações de frequência entre fragmentos de sequências de nucleotídeos de um genoma. O método possui aplicações na verificação de erros em um genoma montado a partir de fragmentos oriundos dos diferentes tipos de tecnologias de sequenciamento e auxiliar na construção de genomas sintéticos, como por exemplo. Pode ser empregado para compressão de material genético, pois as relações de frequência determinadas pelo método permitem reduzir a complexidade de sequências de nucleotídeos, de forma a representar seu conteúdo de maneira comprimida, reduzindo assim o espaço necessário para seu armazenamento.

Referências:




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